熊本県内科医会は全国組織としての一般社団法人日本臨床内科医会（日臨内）に属しています。従いまして、熊本県内科医会にご入会いただく先生には日臨内にもご入会いただきます。県内科医会の会員数は現在約320名（日臨内は、13,377名）であり、学問を中心とした日本内科学会と異なり日臨内は地域医療に携わる臨床内科医の諸問題の解決などに力を注いでおります。近年、日臨内の法人化、認定医、専門医制度の確立により、一層組織力が高まるとともに、医療保険･介護保険に関しては、診療報酬の問題点を浮き彫りにして、会員に情報提供する一方で、内保連や中医協に提言し、これまで多くの提言が診療報酬改定に取り入れられています。 日臨内の事業としては、主として以下のことが挙げられます。

また、日臨内の具体的な行事及び開始などの発行は以下の通りです。